針對這一點，投信業者直言，這與原本標榜「共同基金不用課稅」的精神明顯違背，對財政部的決定都覺得「傻眼」。一位本土投信副總經理強調，「這會反映在淨值上，當（加權指數）8,500點以上時，淨值就會漲得比較慢，投資人恐怕乾脆不買（台股基金），轉而把資金匯到海外投資。」這樣一來，對投資人心理影響而造成的基金贖回潮，業者現在多表示，「無法評估」會有多大！因為擔心危及整個產業的生存，投信投顧公會主管透露，目前已透過管道向財政部爭取，希望既然「一般共同基金不用課稅」，能將台股基金買賣股票部分也能減免，以免政府在景氣一片低迷下，還加壓打垮國內投信業者！
也就是說，若台股基金賣出的是IPO股票和興櫃股票，即使有獲利，但只要不將這部分收益拿出來「分配」給投資人，而是把獲利持續累積在基金淨值中，那麼財政部就不會課徵這部分的證所稅。由於目前市場上大多數台股基金，在公開說明書上都載明：「本基金之收益，全部併入本基金之資產，不予分配」，那麼幾乎買賣這類股票，都能替投資人達到「避風港」的免稅效果。
雖然如此，業界認為，台股基金這部分的受益不大。因為除非投資人專門購買中小型台股基金，且其標榜投資興櫃和IPO股票，才能享受此一避風港效果。其他多數台股基金主要交易對象都還是中大型上市櫃個股，投資人能享受到的避風港效果恐怕有限。
此外，如果把台股基金和投信代管的政府退休基金相比，台股基金要課證所稅，政府退休基金卻免課，因為賦稅署解釋，勞退等4大基金的受益人是「政府」，由於「政府單位免課稅」，所以即使政府基金委外由基金公司代操，未來就算台股來到8,500點以上，這些政府基金帳戶內的股票賺了錢，是不會被課證所稅的。
▲台股基金難逃證所稅大網